对于 iPhone 用家而言，不少即时通讯应用程式如 WhatsApp 及 Telegram，都设有应用程式锁定功能，要求用家必须通过生物认证，才可以进入程式。可是，向来很多人常用的 Facebook Messenger，却一直未有相关功能，难以保障用家私隐。幸好，现时 Messenger 已为 iOS 版用家补回此功能。
由现时起，只要 iPhone 用家将 Messenger 更新至最新版本，就可以启用应用程式锁定功能。这项功能藏在设定页的「私隐设定」内，就可以启用以 FaceID 或 TouchID 锁定及解锁 Messenger。过程中，Facebook 表明不会收集及储存用家的 FaceID / TouchID。
当 Messenger 处于锁定状态，用家仍可以透过系统通知回覆讯息以至接听电话。至于退出 Messenger 后何时启用锁定功能，这方面亦可由用家自行设定，短至一离开程式便立即上锁，以至退出后一小时才上锁都可以。
如一众 iPhone 用家认为有需要加强保障私隐，不欲其他人轻易查看自己于 Messenger 内的讯息，都可以考虑启用上述功能。当然，前提是要把程式更新至最新版本。
