对传输的资料加密，保护传输的资料，详细的做法说明如下：
1.连续按两下桌面的捷径图示，开启 FileZilla Server〈FileZilla Server预设电脑开机时会自动启动〉。
2.点选「Edit\\Settings」。
3.在「SSL/TSL」的索引标签，勾选「Enable FTP over SSL/TSL support (FTPS)」，启用「SSL/TSL」。
4.点选「Generate new certificate…」，建立新的凭证〈FTPS连线需要凭证才能连线〉。
5.输入国家、地区、城市…等指定的资料，点选「Browse…」。
6.选择储存凭证的资料夹，点选「存档」。
7.点选「Generate new certificate」，建立凭证。
8.凭证已经建立完成，点选「确定」。
9.预设的连接埠为「990」，可以依照需要自行更改为其他连接埠，设定完成，点选「OK」。
10. SSL/TSL已经设定完成，使用者可以登入FileZilla Server，上传或下载档案。
11.使用者连续案两下桌面的FTP登入程式FileZilla Client〈详见：FileZilla下载与安装〉，就可以登入FileZilla Server。
12.点选「档案\\站台管理员…」。
13.点选「新增站台」。
14.输入站台名称，建立新站台。
15.在「一般设定」的索引标签，输入主机IP，「加密」选择「需要透过隐含式TSL的FTP」。
16.「登入类型」选择「一般」，输入使者名称和密码。
17.点选「连线」，使用资料加密的方式连线。
18.第一次连接到FileZilla Server会出现下列画面，勾选「总是信任未来连线的凭证」，点选「确认」。
19.已经连接到FileZilla Server，出现「425 Can't open data connection.，无法取得目录表列」错误，必须更改FileZilla Client的设定，才能显示目录表列。
20.点选「编辑\\设定…」。
21.在「FTP」的选项，预设为「被动模式(推荐)」，如下图所示。
22.选择「主动模式(A)」，点选「确认」。
23.点选「档案\\站台管理员…」。
24.点选「连线」。
25.点选「确认」，终止先前的连线，并在目前的页签连线。
26.已经连线成功并取得目录列表，可以使用TSL的FTP，下载或上传档案。
