与现有的Galaxy S21 Ultra一样，三星最新推出的Galaxy Z Fold 3都会支援S Pen输入功能，方便用家以手写方式输入文字以至绘图。有些人可能认为，如果手上已有S Pen，相信可在新机上使用。不过三星提醒一众準用家，新机必须用新笔。
最近，三星提醒一众将会使用Galaxy Z Fold 3的用家，新机只支援两款S Pen，分别是S Pen Pro及S Pen Fold Edition，并只可用于Z Fold 3的主萤幕。其他型号的S Pen都不可用于Z Fold 3，否则会导致Z Fold 3的萤幕损坏。他们解释，两款新S Pen都配备特别设计的笔头，限制接触Z Fold 3萤幕的力度，不会因力度过大而破坏萤幕。换言之，因其他旧版的S Pen并没有这种设计，所以并不适合用于Z Fold 3。
